La industria azucarera en El Salvador es un importante motor de la economía, ya que su actividad aporta el 2.6% del PIB nacional, esta industria produce tres tipos principales de subproductos dentro de su proceso agroindustrial, los cuales son: el bagazo, la cachaca y la melaza, todos aprovechables en diversas formas y niveles. La melaza, es un compuesto que contiene una gran cantidad de azucares, por lo que a nivel mundial su principal uso a sido orientado para la producción de etanol y otros biocombustibles; sin embargo, su versatilidad es muy alta y en diversos reportes científicos y técnicos, se hace referencia a esta como materia prima para la producción de ácido cítrico y otros ácidos orgánicos por medio de procesos fermentativos mayoritariamente. Durante la ejecución de la presente investigación se utilizó la melaza como materia prima para la producción de ácido cítrico a través de una fermentación sumergida del hongo Aspergillus niger; para esto fue necesaria la caracterización de la melaza, determinándose que en promedio posee un 44.84 % de azucares reductores y un 36.47% de sacarosa, lo cual la convierte en una extraordinaria fuente de carbono para el metabolismo del A. niger. Las condiciones ideales para la producción de ácido cítrico a escala de planta piloto fueron establecidas luego de una serie de experimentos a menor escala que permitieron evaluar una a una estas condiciones, obteniéndose que para nuestra planta piloto se necesita un porcentaje de saturación de oxigeno mayor al 35%, un pH inicial de 4.5, una agitación constante con deflectores y a una velocidad de 200 rpm y una temperatura de 25±2ºC, para obtener un rendimiento máximo de 78.8 g/L de ácido cítrico durante la fermentación final. Con ello queda demostrada la posibilidad de obtener productos de mayor valor agregado a partir de las corrientes de desecho o sub productos de la agroindustria, específicamente la melaza, reduciendo así en gran medida la posibilidad de que ocurra un derrame de la misma a causa de su almacenamiento, lo que contribuiría a mantener la calidad del medio ambiente circundante a los ingenios del país.